Аудиту подвергаются как правило показатели тех областей хозяйственной деятельности, которые при оценке имущественного состояния и финансовых результатов равны или выше уровня существенности (5% при анализе баланса и Отчета о финансовых результатах и 7% при анализе этих показателей в динамике (как правило за трехлетний период)).

Среди отобранных для проверки областей учета особое внимание уделяется тем областям, которые напрямую влияют на результат деятельности: формирование доходов (выручка от продаж), финальный результат (рентабельность, чистая прибыль, способность продолжать деятельность (отсутствие признаков банкротства), деловая репутация, рейтинг).

При этом аудитор выявляет не только отклонения в ведении бухгалтерского учета и составления отчетности, но и налоговые комплаенс-риски.

Комплаенс-риски проявляются в форме применения юридических санкций или санкций регулирующих органов, финансовых или репутационных потерь как результат несоответствия законам, общепринятым правилам и стандартам.

Снизить отрицательное влияние комплаенс-рисков  позволяет правильная организация работы структурного подразделения (служба внутреннего контроля).